ในบรรดาเสาหลัก 4 ประการของการศึกษาที่ โรงเรียนธรรมชาติสิงหนครวิทฯ ซึ่งสร้างขึ้นด้วยหลักสูตรเฉพาะที่ออกแบบโดยทีมผู้ปฏิบัติงานด้านการศึกษาและด้วยคำแนะนำจากเขตพื้นที่การศึกษา สำหรับ Playgroup, โรงเรียนอนุบาล, โรงเรียนประถมศึกษาถึงมัธยมศึกษาตอนต้น ระดับโรงเรียน มีหลักสูตร Logic ซึ่งเป็นส่วนสำคัญของกระบวนการศึกษาในโรงเรียนของเรา

หลักสูตร logic ได้รับการออกแบบและพัฒนาเพื่อตอบสนองความต้องการของนักเรียนในกิจกรรมการเรียนรู้ที่ให้ความสนใจกับการเติบโต  logic และการวิเคราะห์ของนักเรียน ด้วยความเชื่อที่ว่าการกำเนิดของคนรุ่นใหม่ที่สร้างสรรค์และนวัตกรรมไม่สามารถแยกออกจากความสามารถของนักเรียนในการคิดอย่างมีวิจารณญาณ หลักสูตรlogic ที่ โรงเรียนธรรมชาติสิงหนคร จึงมีมาตรฐานความสำเร็จและแผนกิจกรรมจำนวนหนึ่งที่ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถฝึกฝนตรรกะและ ทักษะการคิดเชิงวิเคราะห์เพื่อให้ไม่เพียงแต่สามารถทำงานที่ได้รับมอบหมายให้สำเร็จเท่านั้น (คำศัพท์ที่ใช้สำหรับครู) แต่ยังรับรู้ถึงความเชื่อมโยงระหว่างความรู้ที่ศึกษากับการประยุกต์ใช้ในชีวิตจริง ด้วยวิธีนี้ นักเรียนที่ โรงเรียนธรรมชาติสิงหนครวิทยานุสรณ์ จะเติบโตเป็นคนรุ่นที่ฉลาดและสามารถคิดอย่างมีเหตุผลและวิเคราะห์ เพื่อให้สามารถแก้ไขปัญหาต่างๆ ที่พวกเขาเผชิญอยู่ได้

     หลักสูตร Logic ของ โรงเรียนธรรมชาติสิงหนครวิทยานุสรณ์ ก็มีวิธีการพิเศษในการดำเนินการเช่นกัน เพราะการศึกษาที่ดีก็เกิดจากกลยุทธ์การสอนที่เหมาะสมและสอดคล้องกับการเติบโตของนักเรียนในแต่ละระดับ ดังนั้น ผู้ปฏิบัติงานด้านการศึกษาที่รับผิดชอบคุณภาพการเรียนรู้จะได้รับคำแนะนำต่างๆ เมื่อเวลาผ่านไป เริ่มตั้งแต่การฝึกอบรมการจัดการห้องเรียน การประชุมเชิงปฏิบัติการทบทวนหลักสูตร และกลยุทธ์การจัดการนักเรียน ทั้งหมดนี้เพื่อให้แน่ใจว่านักเรียนจะได้รับประสบการณ์การเรียนรู้ที่มีคุณภาพและสอดคล้องกับระบบการสร้างสรรค์จากธรรมชาติ (Sunnatullah) ทั้งที่โรงเรียนและที่บ้าน